索尼克 是一只蓝色的刺猬，原本快乐的生活在自己的星球上。然而，邪恶的势力觊觎索尼克所拥有了超快速度，想要将这一门绝技夺走，为了保护索尼克，善良的猫头鹰养母给了索尼克一包魔力环，它可以帮助索尼克传送到安全的星球上。就这样，索尼克来到了地球，降落在了位于蒙大拿州的青山市。起初，索尼克在这里生活的非常惬意，并且结交了一批好友。当政府发现了索尼克的存在后，一切都变得复杂起来。政府派出了邪恶的科学家蛋头博士，命令他捉住索尼克，对他进行可怕的科学研究。为了躲避蛋头博士的追捕，索尼克和警长汤姆 必须前往旧金山，取得丢在那里的魔力环。

索尼克在绿丘镇安顿下来之后，就急着要证明自己有能力成为一名真正的英雄。当蛋头博士带着全新的搭档纳克鲁斯，又回来寻找一块力量强大足以毁灭人类文明的翡翠的时候，他就面对了另一个严峻的考验。这次索尼克和他自己的跟班塔尔斯携手合作，一起踏上一场环游世界的冒险旅程，希望能在那块翡翠落入坏人手中之前先找到它。

偷走矛盾棱镜的奈恩想要创造一个只属于他自己的世界，索尼克必须与出人意料的盟友合作，才能守护这个碎裂宇宙。

在碎裂宇宙各路盟友的帮助下，索尼克与混沌议会展开较量，争夺威力巨大的矛盾棱镜 — 一次一个碎片。

与蛋头博士的一场大战摧毁了宇宙，索尼克争分夺秒穿越平行世界，试图和朋友们重新取得联系并拯救世界。